Usa-Places.com перечислил около 20 церкви в Джефферсон Сити. Некоторые из лучших церкви в Джефферсон Сити являются- Церковь Solid Rock, Столица Западной христианской церкви, Семейная церковь Дом молитвы, Церковь адвентистов седьмого дня, Достопримечательность церкви, Церковь живой надежды, Голгофа Ассамблеи Бога, Часовня Вудкреста, Церковь Христа & Церковь Назарянина.