Usa-Places.com перечислил около 16 школы в Уотертаун. Некоторые из лучших школы в Уотертаун являются- Средняя школа Уотертауна, Школа Гарольда Т. Уайли, Школа Knickerbocker, Школа на улице Огайо, Джефферсон-Льюис БОСЕС, Детский сад на дереве, Летная школа Конли, Школьный округ Уотертаун-Сити, Совет по образованию Джеффа-Льюиса & Заповедник Даунибрук.